Alur Cerita:

Musim kedua Spy Kyoushitsu kembali mengikuti Lamplight, tim mata-mata Republik Din yang selalu bergerak di balik bayang-bayang. Kali ini, Thea, Monika, Erna, dan Annett ditugaskan memburu seorang mata-mata musuh. Namun, perbedaan karakter yang tajam membuat kerja sama mereka goyah, hingga sebuah pertemuan tak terduga dengan Matilda, wanita yang mengaku sebagai ibu Annett, perlahan menyeret mereka ke pusaran konflik yang kian membesar dan menguji kepercayaan di antara mereka. Di saat yang sama, anggota Lamplight lain menyadari skuad yang dikirim belum juga memberi kabar. Dihantui firasat buruk, Klaus dan Lily memulai pencarian darurat, menelusuri jejak yang mengarah pada ketegangan berbahaya di wilayah terakhir rekan-rekan mereka terlihat. Waktu terus menipis, dan mereka harus segera menyatukan kembali Lamplight sebelum misi ini melangkah terlalu jauh untuk dihentikan.