Alur Cerita:

Klub Penelitian Robotika Sekolah Menengah Atas Tanegashima Pusat selalu bercita-cita untuk menyelesaikan GunPro1, robot raksasa yang berfungsi penuh. Selama bertahun-tahun, para anggota klub telah berkontribusi terhadap kemajuannya dan kini menjadi tujuan Akiho Senomiya untuk akhirnya mewujudkan impian semua anggota klub di masa lalu menjadi kenyataan. Namun, segala sesuatunya tidak semudah yang terlihat karena klub kekurangan dana untuk melakukan upaya sebesar itu. Selain itu, satu-satunya anggota klub lainnya, Kaito Yashio, tidak menunjukkan minat untuk membantu teman masa kecilnya dan malah menikmati permainan pertarungan mecha di "PokeCom" miliknya. Saat Kaito sedang menyia-nyiakan hari-harinya, dia menerima pesan yang tidak dapat dipahami dan mendengar suara yang sepertinya tenggelam oleh suara statis. Dia mencari sumbernya, hanya untuk menyadari bahwa itu berasal dari Airi Yukifune, sebuah AI yang hanya ada dalam sistem augmented reality yang dapat diakses melalui PokeCom. Robot; Notes mengikuti kisah Kaito saat dia menemukan laporan aneh di database Airi, yang akan menimbulkan konsekuensi bencana di masa depan.