Alur Cerita:

Dengan pemandangan yang menakjubkan dan rakyat yang makmur, Jepang Raya menjadi negara yang dikagumi oleh semua negara lain. Namun, ancaman serius mengintai negara tersebut. Para penjaga misterius yang dikenal sebagai Master Samurai adalah satu-satunya pertahanan Jepang Raya. Atas perintah dewan siswa, samurai muda Muneakira Yagyuu tiba di Sekolah Akademik Buou. Dikelola oleh Keshogunan Tokugawa, di sini anak-anak prajurit diberi pendidikan aristokrat yang dibutuhkan untuk menjalankan negara. Sekolah ini dipimpin oleh ketua dewan siswa Yoshihiko Tokugawa dan saudara perempuannya, Sen, yang juga merupakan teman masa kecil Muneakira. Setibanya di akademi, Muneakira mendapati dirinya berada di tengah-tengah pertempuran yang mengerikan. Di tengah kekacauan, langit dipenuhi cahaya putih yang aneh dan seorang gadis misterius bernama Juubei Yagyuu muncul dan tiba-tiba mencium Muneakira. Dengan ciumannya, ia membangkitkan kekuatan yang tidak diketahui yang melindungi mereka. Siapakah gadis ini, dan dari mana dia berasal? Muneakira mendapati dirinya terjerat dalam nasib negara dan ancaman yang akan mengguncang Jepang Raya hingga ke akarnya. Ia harus mempelajari rahasia di balik Master Samurai dan ciuman yang membangkitkan kekuatan Juubei untuk melindungi negaranya.