Alur Cerita:

Dua tahun lalu, dunia berubah selamanya. Cloud Strife muda dan kelompoknya mungkin telah mengalahkan Sephiroth dan menggagalkan rencananya untuk menabrakkan meteor raksasa ke Bumi, tetapi kemenangan ini tidak tanpa pengorbanan besar. Kota Midgar yang padat penduduk hampir hancur dalam konflik tersebut. Untungnya, banyak warga kota berhasil mengungsi ke tempat aman, dan di tahun-tahun berikutnya telah membentuk rumah baru bernama Edge. Final Fantasy VII: Advent Children berpusat pada Cloud dan Tifa saat mereka mencoba membangun kehidupan baru untuk diri mereka sendiri, serta untuk orang-orang di sekitar mereka, di kota baru ini. Bersama-sama mereka menjalankan layanan kurir, dan merawat putri angkat teman mereka Barret, Marlene, dan seorang anak yatim piatu bernama Denzel. Denzel, Cloud, dan banyak anak menderita penyakit baru misterius yang disebut "Geostigma." Anak-anak di kota itu memiliki satu ancaman lain yang mengintai di atas kepala mereka—tiga orang kuat menculik anak-anak yang terinfeksi karena alasan yang tidak diketahui. Cloud bertekad untuk menyelamatkan anak-anak muda ini, tidak hanya dari Geostigma, tetapi juga dari para penculik. Namun, dia tidak tahu bahwa orang-orang ini memiliki hubungan dengan musuh lamanya, Sephiroth, dan pencarian Cloud untuk mengalahkan mereka akan membawanya kembali ke dalam konflik dengan iblis-iblis masa lalunya. Jika ada harapan untuk menaklukkan ancaman ini, harapan itu terletak pada ikatan persahabatan antara Cloud dan sekutunya yang pernah menyelamatkan dunia, dan sekarang harus melakukannya lagi.