Alur Cerita:

Setelah menaklukkan galaksi, umat manusia telah mencapai puncak kejayaannya dan kini mengalami penurunan yang stabil. Sumber daya alam semesta semakin menipis, dan sekitar 500 miliar manusia mulai kembali ke Bumi. Dengan demikian, dimulailah perang antara berbagai faksi manusia untuk menguasai planet ini. Akhirnya, sebuah pemerintahan otoriter yang dikenal sebagai Gaia Sanction mencegah pemukiman kembali Bumi. Kapten Herlock adalah salah satu anggota Elite Wing yang ditugaskan oleh Gaia Sanction untuk mempertahankan Bumi. Armada kapalnya tak terkalahkan di bawah komandonya. Namun, Gaia Sanction mengizinkan elit diplomatik untuk berimigrasi ke Bumi, yang membuat Herlock marah. Ia memberontak dan menembaki para diplomat dan sisa armadanya. Ia memutuskan untuk melepaskan materi gelap ke planet ini untuk membuatnya tidak layak huni, tetapi juga tertelan olehnya yang membuatnya abadi. Seratus tahun telah berlalu, dan Kapten Herlock yang legendaris masih buron, hanya Arcadia yang berada di bawah kendalinya. Gaia Sanction terus melanjutkan rencana mereka untuk menguasai Bumi, sambil menyembunyikan keadaan sebenarnya. Namun Kapten Herlock sedang mempersiapkan pertarungan terakhir dengan mereka, yang akan menentukan nasib dunia!