Alur Cerita:

Ishi Okoshi Saat mencari Nyanko-sensei, Takashi Natsume bertemu dengan youkai yang lemah lembut dan berpenampilan kecil, Mitsumi. Mitsumi dipercaya oleh pemimpinnya, Gantetsu, seorang ayakashi yang kuat dan perkasa, untuk menjadi "Ishi Okoshi" tahun ini, yang tugasnya adalah membangunkannya dari tidur lelapnya. Melihat betapa Mitsumi ingin membuktikan dirinya sebagai pelayan Gantetsu yang layak, Natsume memutuskan untuk membantunya memenuhi tugasnya. Namun, waktu terus berjalan—karena mereka bukan satu-satunya yang ingin membangunkan makhluk suci itu. Ayashiki Raihousha Suatu hari, teman Natsume, Kaname Tanuma, dikunjungi oleh seorang pria asing. Pada hari-hari berikutnya, pengunjung itu berbicara sebentar dengan Tanuma dan pergi. Natsume segera mengetahui bahwa orang luar itu adalah youkai yang menyamar sebagai manusia, yang mengaku tidak menanggung bahaya. Meskipun mempercayai youkai itu, kesehatan Tanuma perlahan mulai memburuk, menyebabkan Natsume menjadi lebih curiga terhadap penyusup itu. Apa kebenaran di balik kemunculannya yang tiba-tiba dan hubungannya dengan Tanuma?